Bowmore была основана в 1779 году Джоном П. Симпсон. Как и большинство других винокурен Bowmore была создана как фермерская винокурня. Он назвал винокурню "Bowmore", что на Гэльском означает "большой риф".
После его смерти винокурня попала в руки немецкой семьи Mutter. Они изменили производство на более современный процесс, а также купили пароход для снабжения винокурни импортным ячменем и углем.
Винокурня оставалась в руках немцев до 1925 года, когда они продали ее J. B. Sherriff and Co.
Во время Второй Мировой Войны винокурня была закрыта, а в 1951 году была основана компания Bowmore Morrison. Позже в 1994 году японская компания Suntory купила Bowmore и до сих пор владеет ими.